西増 弘志
助教 西増 弘志(にします ひろし)
学歴 ↑
- 1998年
- 北海道北見北斗高校卒業
- 1998年
- 東京大学教養学部理科I類入学
- 2002年
- 東京大学農学部応用生命科学課程生命工学専修卒業
- 2002年
- 同 大学院農学生命科学研究科応用生命工学専攻修士課程入学
- 2004年
- 同 博士課程進学
- 2007年
- 博士(農学)(東京大学)取得
職歴 ↑
- 2006年
- 日本学術振興会特別研究員DC2
- 2007年
- 日本学術振興会特別研究員PD
- 2007年
- 東京工業大学 生命理工学研究科 生命情報専攻 COE特任助教
- 2008年
- 東京大学 医科学研究所 基礎医科学部門 染色体制御分野 助教
- 2010年
- 東京大学大学院 理学系研究科 生物化学専攻 特任助教
- 2013年
- 東京大学大学院 理学系研究科 生物化学専攻 助教
- 2014年
- 科学技術振興機構(JST) さきがけ研究者(兼任)
- 現在に至る
発表論文 ↑
- "Structures and mechanisms of CRISPR RNA-guided effector nucleases."Curr Opin Struct Biol, (2016).
- "Crystal Structure of Silkworm PIWI-Clade Argonaute Siwi Bound to piRNA."Cell, 167 484-497 (2016).
- "Structural and functional insights into IZUMO1 recognition by JUNO in mammalian fertilization"Nat Commun, 7 12198 (2016).
- "Crystal structure of the plant receptor-like kinase TDR in complex with the TDIF peptide."Nat Commun, 7 12383 (2016).
- "Crystal Structure of Cpf1 in Complex with Guide RNA and Target DNA."Cell, 165 (2016).
- "Structural basis for specific inhibition of Autotaxin by a DNA aptamer."Nat Struct Mol Biol, 23 395-401 (2016).
- "Structural Basis for the Altered PAM Specificities of Engineered CRISPR-Cas9."Mol Cell, 61 886-894 (2016).
- "Structure and biological function of ENPP6, a choline-specific glycerophosphodiester-phosphodiesterase"Sci Rep., 6 20995 (2016).
- "Structure and Engineering of Francisella novicida Cas9"Cell., 164 950-961 (2016).
- "Glyceraldehyde Oxidoreductase Isozymes Exhibit Diverse Substrate Specificities through Unique Subunit Assemblies."PLoS One, 11 e0147333 (2016).PubMed: link
- "Crystal structure of Staphylococcus aureus Cas9."Cell, 16 1113-1126 (2015).
- "Crystal structure and activity of the endoribonuclease domain of the piRNA pathway factor Maelstrom."Cell Rep, 11 366-375 (2015).
- "Genome-scale transcriptional activation by an engineered CRISPR-Cas9 complex."Nature, 517 583-588 (2015).PubMed: link
- "Expression, purification, crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of Enpp6."Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun, 70 794-799 (2014).PubMed: link
- "Crystal structure of Cas9 in complex with guide RNA and target DNA."Cell, 156 935-949 (2014).
- "Structural basis for potent inhibition of SIRT2 deacetylase by a macrocyclic peptide inducing dynamic structural change."Structure, 22 345-352 (2014).
- "Screening and X-ray crystal structure-based optimization of autotaxin (ENPP2) inhibitors, using a newly developed fluorescence probe."ACS Chem Biol, 8 1713-1721 (2013).
- "The tRNA recognition mechanism of folate/FAD-dependent tRNA methyltransferase (TrmFO)."J Biol Chem, 287 42480-42494 (2012).PubMed: link
- "Expression, purification, crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of Zucchini from Drosophila melanogaster."Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun, 68 1346-1350 (2012).PubMed: link
- "Structure and function of Zucchini endoribonuclease in piRNA biogenesis."Nature, 491 284-287 (2012).
- "Specific recognition of linear polyubiquitin by A20 zinc finger 7 is involved in NF-κB regulation."EMBO J, 31 3856-3870 (2012).
- "Crystal structure of Enpp1, an extracellular glycoprotein involved in bone mineralization and insulin signaling."Proc Natl Acad Sci USA, 109 16876-16881 (2012).
- "Molecular dynamics simulation of autotaxin: roles of the nuclease-like domain and the glycan modification."J Phys Chem B, 116 11798-11808 (2012).PubMed: link
- "Expression, purification, crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of Enpp1."Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun, 68 778-782 (2012).PubMed: link
- "A 3D view of autotaxin."Trends Pharmacol Sci, 33 138-145 (2012).PubMed: link
- "Structural basis for the bifunctionality of fructose-1,6-bisphosphate aldolase/phosphatase."Nature, 478 538-541 (2011).
- "Crystal structure of autotaxin and insight into GPCR activation by lipid mediators."Nature Struct Mol Biol, 18 205-212 (2011).
- "Crystal structure of a PFU-PUL domain pair of Saccharomyces cerevisiae Doa1/Ufd3."Kobe J Med Sci, 56 125-139 (2010).
- "Structural basis of novel interactions between the small-GTPase and GDI-like domains in prokaryotic FeoB iron transporter."Structure, 17 1345-1355 (2009).
- "Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of the truncated cytosolic domain of the iron transporter FeoB."Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun, 65 784-787 (2009).PubMed: link
- "Structural basis of AdoMet-dependent aminocarboxypropyl transfer reaction catalyzed by tRNA-wybutosine synthesizing enzyme, TYW2."Proc Natl Acad Sci USA, 106 15616-15621 (2009).
- "Atomic structure of a folate/FAD-dependent tRNA T54 methyltransferase."Proc Natl Acad Sci USA, 106 8180-8185 (2009).
- "Crystal structures of an ATP-dependent hexokinase with broad substrate specificity from the hyperthermophilic archaeon Sulfolobus tokodaii."J Biol Chem, 282 9923-9931 (2007).
- "Identification and characterization of an ATP-dependent hexokinase with broad substrate specificity from the hyperthermophilic archaeon Sulfolobus tokodaii."J Bacteriol, 188 2014-2019 (2006).PubMed: link
- "Expression of acetylcholine (ACh) and ACh-synthesizing activity in Archaea."Life Sci, 77 1935-1944 (2005).PubMed: link
- "The first crystal structure of the novel class of fructose-1,6-bisphosphatase present in thermophilic archaea."Structure, 12 949-959 (2004).
日本語記事 ↑
- "Cas9の結晶構造"日本結晶学会誌, 57 96-103 (2015).
- "Cas9-ガイド鎖RNA-標的DNA三者複合体の結晶構造"ライフサイエンス 新着論文レビュー, http://first.lifesciencedb.jp/archives/8416 (2014).
- "ユビキチンシグナルの構造生物学"生化学, 85 423-429 (2013).
- "校正刷り論文の図を見てがっかりしないために"蛋白質科学会アーカイブ, http://www.pssj.jp/archives/Opinion_Essay/Essay/Es_04/Es_04.html (2013).
- "「真の」二機能性酵素の発見とその「変身」のメカニズム"化学と生物, 50 730-737 (2012).
- "ZucchiniはpiRNAの産生に必須のエンドリボヌクレアーゼである"ライフサイエンス 新着論文レビュー, http://first.lifesciencedb.jp/archives/5850 (2012).
- "変形する鍵穴"生物物理, 52 198-200 (2012).
- "1つの酵素が2つの反応を触媒するしくみ"日本結晶学会誌, 54 213-118 (2012).
- "脂質メディエーター産生酵素オートタキシンの構造機能解析"実験医学増刊 シグナル伝達研究最前線2012, 30 42-48 (2012).
- "糖新生経路ではたらく酵素フルクトース-1,6-ビスリン酸アルドラーゼ/ホスファターゼは“変形”して2つの反応を触媒する"ライフサイエンス 新着論文レビュー, http://first.lifesciencedb.jp/archives/3444 (2011).
- "脂質メディエーター産生酵素ATXの結晶構造"日本結晶学会誌, 53 207-212 (2011).
- "がん転移の原因タンパク質の立体構造"東京大学理学系研究科・理学部ニュース, 43 17 (2011).
- "脂質メディエーター産生酵素オートタキシンの結晶構造"ライフサイエンス 新着論文レビュー, http://first.lifesciencedb.jp/archives/2034 (2011).
- "RNAサイレンシング因子の構造生物学"実験医学増刊 拡大・進展を続けるRNA研究の最先端, 28 107-113 (2010).
- "超好熱性古細菌の新規なヘキソキナーゼの基質結合に伴う構造変化"PF NEWS, 25 22-25 (2007).
プレスリリース ↑
平成27年
「ゲノム編集のための"小さなはさみ"のかたち」
― 小型CRISPR-Cas9の立体構造を解明 ―
http://www.s.u-tokyo.ac.jp/ja/press/8654/
平成26年
「ゲノムDNAを自在に切断する"はさみ"のかたち」
http://www.s.u-tokyo.ac.jp/ja/press/2014/06.html
平成24年
「ゲノムを変異から守る小さなRNAが作られる仕組みを解明」
http://www.jst.go.jp/pr/announce/20121015/index.html
「骨疾患や糖尿病発症に関わるタンパク質の構造と機能を解明」
http://www.s.u-tokyo.ac.jp/ja/press/2012/37.html
「日本人に多い非ホジキンリンパ腫の、ユビキチン化を介した発症機構の解明」
http://www.s.u-tokyo.ac.jp/ja/press/2012/36.html
平成23年
「原始生命がもつ一人二役の酵素」
http://www.kek.jp/ja/NewsRoom/Highlights/20111020120000/
「形を変える鍵穴:生化学の常識を覆す2種類の反応を触媒する酵素」
http://www.u-tokyo.ac.jp/ja/todai-research/research-highlights/a-bifunctional-enzyme/
「2種類の化学反応を触媒する酵素が「変身」する姿を世界で初めてとらえた」
http://www.s.u-tokyo.ac.jp/ja/press/2011/02.html
「がん転移の原因タンパク質の構造解明」
http://www.s.u-tokyo.ac.jp/ja/press/2011/02.html
平成19年
「「原始生命の反応を探る」〜 超好熱性古細菌のヘキソキナーゼの働き 〜
http://legacy.kek.jp/newskek/2007/julaug/Hexokinase.html
「「原始的な糖代謝系酵素の新規な構造:好酸好熱性古細菌由来ヘキソキナーゼと基質との複合体の立体構造を原子レベルで解明」
http://www.a.u-tokyo.ac.jp/topics/wakagi.html
賞与 ↑
平成26年
日本結晶学会 進歩賞
日本生化学会 奨励賞
SPRUC 2014 Young Scientist Award
文部科学大臣表彰 若手科学者賞
平成24年
第12回日本蛋白質科学会年会 若手奨励賞
平成23年
第84回日本生化学会大会 鈴木紘一メモリアル賞
平成18年
東京大学大学院農学生命科学研究科長賞