助教　塚崎　智也（つかざき　ともや）

学歴 ↑

平成18年

京都大学博士(理学)取得

職歴 ↑

平成18年

東京工業大学 博士研究員

平成19年

東京工業大学 グローバルCOE特任助教

平成20年

東京大学 医科学研究所 助教

平成22年

東京大学 大学院理学系研究科 生物化学専攻 助教

平成24年

科学技術振興機構 さきがけ 研究者(兼任)

主要論文 ↑

1. "Structure and function of a membrane component SecDF that enhances protein export."
   Tsukazaki T, Mori H, Echizen Y, Ishitani R, Fukai S, Tanaka T, Perederina A, Vassylyev D, Kohno T, Matsurana A, Ito K, Nureki O,
   Nature, 474 235-238 (2011).
   PubMed: link, PDB: 3AQP 3AQO 2RRN
2. "Conformational transition of Sec machinery inferred from bacterial SecYE structures."
   Tsukazaki T, Mori H, Fukai S, Ishitani R, Mori T, Dohmae N, Perederina A, Sugita Y, Vassylyev D, Ito K and Nureki O,
   Nature, 455 988-991 (2008).
   PubMed: link, PDB: 2ZJS 2ZQP

賞与 ↑

平成24年
　　科学技術分野の文部科学大臣表彰 若手科学者賞　受賞
　　「細胞におけるタンパク質膜透過装置の構造と機能の研究」

平成22年
　　日本生物物理学会若手奨励賞　受賞
　　「Sec トランスロコンと共に機能する SecDF 膜タンパク質の構造」

平成21年
　　日本蛋白質科学会若手奨励賞　受賞
　　「細菌型 Sec トランスロコンの構造から明らかとなったタンパク質膜透過装置の構造変化」

発表論文 ↑

1. "Crystal structure of the channelrhodopsin light-gated cation channel."
   Kato HE, Zhang F, Yizhar O, Ramakrishnan C, Nishizawa T, Hirata K, Ito J, Aita Y, Tsukazaki T, Hayashi S, Hegemann P, Maturana AD, Ishitani R, Deisseroth K, Nureki O,
   Nature, 482 369-374 (2012).
   PubMed: link, PDB: 3UG9
2. "Structure and function of a membrane component SecDF that enhances protein export."
   Tsukazaki T, Mori H, Echizen Y, Ishitani R, Fukai S, Tanaka T, Perederina A, Vassylyev D, Kohno T, Matsurana A, Ito K, Nureki O,
   Nature, 474 235-238 (2011).
   PubMed: link, PDB: 3AQP 3AQO 2RRN
3. "Crystallization and preliminary X-ray diffraction of the first periplasmic domain of SecDF, a translocon-associated membrane protein, from Thermus thermophilus."
   Echizen Y, Tsukazaki T, Dohmae N, Ishitani R, Nureki O,
   Acta. Crystallograph. Sect. F Struct. Biol. Cryst. Commun., 67 1367-1370 (2011).
4. "The mechanism of protein export enhancement by the SecDF membrane component. REVIEW"
   Tsukazaki T, Nureki O,
   BIOPHYSICS, 7 129-133 (2011).
5. "Molecular mechanisms underlying the early stage of protein translocation through the Sec translocon."
   Mori T, Ishitani R, Tsukazaki T, Nureki O, Sugita Y,
   Biochemistry, 49 945-950 (2010).
   PubMed: link
6. "Mg²⁺-dependent gating of bacterial MgtE channel underlies Mg²⁺ homeostasis"
   Hattori M, Iwase N, Furuya N, Tanaka Y, Tsukazaki T, Ishitani R, Maguire ME, Ito K, Maturana A, Nureki O,
   EMBO J, 28 3602-3612 (2009).
   PubMed: link, PDB: 2ZY9
7. "Conformational transition of Sec machinery inferred from bacterial SecYE structures."
   Tsukazaki T, Mori H, Fukai S, Ishitani R, Mori T, Dohmae N, Perederina A, Sugita Y, Vassylyev D, Ito K and Nureki O,
   Nature, 455 988-991 (2008).
   PubMed: link, PDB: 2ZJS 2ZQP
8. "Crystal structure of the translocation ATPase SecA from Thermus thermophilus reveals a parallel, head-to-head dimer."
   Vassylyev DG, Mori H, Vassylyeva MN, Tsukazaki T, Kimura Y, Tahirov TH, Ito K,
   J. Mol. Biol., 364 248-258 (2006).
   PubMed: link, PDB: 2IPC
9. "Cloning, expression, purification, crystallization and initial crystallographic analysis of the preprotein translocation ATPase SecA from Thermus thermophilus."
   Vassylyeva MN, Mori H, Tsukazaki T, Yokoyama S, Tahirov TH, Ito K, Vassylyev DG,
   Acta. Crystallograph. Sect. F. Struct. Biol. Cryst. Commun., 62 909-912 (2006).
   PubMed: link
10. "Purification, crystallization and preliminary X-ray diffraction of SecDF, a translocon-associated membrane protein, from Thermus thermophilus."
    Tsukazaki T, Mori H, Fukai S, Numata T, Perederina A, Adachi H, Matsumura H, Takano K, Murakami S, Inoue T, Mori Y, Sasaki T, Vassylyev DG, Nureki O, Ito K,
    Acta. Crystallograph. Sect. F Struct. Biol. Cryst. Commun., 62 376-380 (2006).
    PubMed: link
11. "Fluorescence resonance energy transfer analysis of protein translocase. SecYE from Thermus thermophilus HB8 forms a constitutive oligomer in membranes."
    Mori H, Tsukazaki T, Masui R, Kuramitsu S, Yokoyama S, Johnson AE, Kimura Y, Akiyama Y, Ito K,
    J. Biol. Chem., 278 14257-14264 (2003).
    PubMed: link
12. "Interactions of cytochrome c peroxidase with lysine peptides."
    Hirota S, Tsukazaki T, Yamauchi O,
    Biochem. Biophys. Res. Commun., 268 395-397 (2000).
    PubMed: link
13. "Interactions of Cytochrome c and Cytochrome f with Aspartic Acid Peptides"
    Hirota S, Endo M, Hayamizu K, Tsukazaki T, Takabe T, Kohzuma T, Yamauchi O,
    J. Am. Chem. Soc., 121 849-855 (1999).
14. "Effects of charged peptides on electron transfer from [Fe(CN)6]4- to cytochrome c or plastocyanin."
    Hirota S, Endo M, Tsukazaki T, Takabe T, Yamauchi O,
    J. Biol. Inor . Chem., 3 563-569 (1998).

総説等 ↑

1. "細菌のタンパク質分泌泌を促進する 膜タンパク質 SecDF の構造と機能"
   森博幸，塚崎 智也,
   化学と生物, 51 in press (2013).
2. "Crystal structure of SecDF, a Sec translocon-associated membrane protein."
   Tsukazaki T, Nureki O,
   SPring-8 Research Frontiers 2011, 22-23 (2012).
3. "Secトランスロコンと共に機能するSecDF膜タンパク質の構造"
   塚崎 智也,
   生物物理, 51 236-237 (2011).
4. "Ｘ線結晶構造解析から解明されたSecDF膜タンパク質の構造"
   塚崎 智也,
   東京大学アイソトープセンターニュース, 42(2) 8-13 (2011).
5. "タンパク質の膜透過を促進する膜タンパク質SecDFの構造と機能"
   塚崎 智也, 森 博幸, 伊藤 維昭, 濡木 理,
   新着論文レビュー, http://first.lifesciencedb.jp/archives/2915 (2011).
6. "タンパク質を膜透過させる分子装置"
   塚崎 智也, 濡木 理,
   化学工業, 62 471-477 (2011).
7. "Conformational Transition of Sec Machinery Inferred from Bacterial SecYE Structures. "
   Tsukazaki T, Nureki O,
   SPring-8 Research Frontiers 2009, 30-31 (2010).
8. "結晶化用膜蛋白質の精製法〜SecDF膜蛋白質をモデルとして〜"
   塚崎 智也,
   蛋白質科学会アーカイブ, 3 e056 (2010).
9. "立体構造解析からみえてきたSecAによる蛋白質の膜透過の駆動機構 Molecular mechanisms of SecA-mediated protein translocation viewed from structural studies"
   森 博幸, 塚崎 智也,
   蛋白質核酸酵素, 54 685-695 (2009).
10. "細菌型Secトランスロコンの構造から明らかとなったタンパク質膜透過装置の構造変化"
    塚崎 智也, 森 博幸,
    生物物理, 49 288-289 (2009).

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